在临床实践中，我们需要对可能引发延髓麻痹的其他疾病进行仔细的鉴别。
对于那些伴随严重肌肉无力的病例，我们需关注其是否出现延髓症状。这类患者的肌肉无力状态在早晨相对较轻，随着夜晚的临近逐渐加重，展现出病态的疲劳感。在对这类患者进行诊断时，如有必要，我们可以为其肌肉注入新斯明以进行药物试验，以此作为辅助诊断的手段。
急性感染性多发性神经炎也是一种需要鉴别的疾病。该病起病较急，患者常常表现出四肢远端的对称性无力，呈现弛缓性瘫痪。在脑脊液检测中，我们会发现蛋白质与细胞分离的现象，这也是该病的一个重要特征。
还有一些疾病，如延髓空洞症和脑干肿瘤等，它们在临床表现上与延髓麻痹有相似之处，但通常伴有感觉障碍。感觉障碍的存在与否，可以作为我们鉴别这些疾病的一个依据。
桥脑小脑角或枕骨大孔区的肿瘤也常常影响延髓神经。这类患者通常表现为一侧性神经受损，同时伴随有感觉障碍。
假性延髓麻痹是一种由两侧皮质延髓束损伤引起的病症。它通常是多次脑血管事故的后遗症，也可见于多发性硬化症患者。这类患者的临床表现为延髓支配的肌肉瘫痪，但没有舌肌萎缩和肌束颤动。他们的软腭反射、咽壁反射和下颌反射可能活跃或增强，有时甚至会出现强烈的哭泣和微笑。对于这些复杂的疾病表现，我们需要深入理解和鉴别，以便为患者提供准确的诊断和治疗。
