在治疗痢疾后综合征的过程中，患者需要特别注意休养，尤其是需要卧床休息来恢复体力。对于口臭问题也要加强护理，保持口腔清洁，避免感染的发生。对于皮肤上的损伤伤口，必须予以保护并妥善治疗，以促进伤口的愈合。为了增强免疫力，患者还需补充维生素C，这有助于提升身体的抵抗力。调整水电解质的酸碱平衡也是治疗过程中不可忽视的一环。
在治疗过程中，肾上腺皮质激素被作为首选药物。这种药物可以通过静脉给药的方式快速发挥作用，一旦症状有所改善，就可以改为口服以维持疗效。除了肾上腺皮质激素，解热镇痛药物如阿斯匹林和抗炎疼痛也可以作为选择，以缓解患者的疼痛不适感。为了预防和控制可能的感染，广谱抗生素的使用也是必要的。
对于慢性滑膜炎的患者，滑膜切除术可能是一个有效的治疗选择。而对于关节损伤的情况，关节融合术可以考虑。虽然少数疾病可以自愈，但痢疾后综合征的死亡率仍然较高，达到了5％～15％，因此治疗时必须高度重视，不容有失。
在整个治疗过程中，患者应当遵循医生的建议，积极配合治疗，保持乐观的心态。家庭成员和社会也应该给予患者足够的支持和关爱，帮助他们度过这段艰难的时期。这样的综合治疗措施将有助于患者尽快康复，重拾健康的生活。
