导致的原因较多，主要有以下几方面。
1。遗传基因缺陷
早期时，的胚胎占50%-60%，多为染色体数目异常，其次为染色体结构异常。数目异常有三体、三倍体及X单体等；结构异常有染色体断裂、倒置、缺失和易位。染色体异常的胚胎多数结局为流产，极少数可能继续发育成胎儿，但出生后也会发生某些功能异常或合并畸形。若已流产，妊娠产物有时仅为一空孕囊或已退化的胚胎。
2。环境因素
影响生殖功能的外界不良因素很多，可以直接或间接对胚胎或胎儿造成损害。过多接触某些有害的化学物质（如砷、铅、苯、甲醛、氯丁二烯、化乙烯等）和物理因素（如放射线、噪音及高温等），均可引起流产。
3。母体因素
（1）全身性疾病：妊娠期患急，可引起子宫收缩而致流产；细菌毒素或病毒（病毒、巨细胞病毒等）通过胎盘进入胎儿血循环，使胎儿死亡而发生流产。此外，孕妇患严重或可致胎儿缺氧，也可能引起流产。孕妇患或高血压，胎盘可能发生梗死而引起流产。
（2）生殖器官疾病：孕妇因子宫畸形（如双子宫、纵隔子宫及子宫发育不良等）、盆腔肿瘤（如子宫肌瘤等），均可影响胎儿的生长发育而导致流产。宫颈内口松弛或宫颈重度裂伤，易因胎膜早破发生晚期流产。
（3）内分泌失调：甲状腺功能减退症、严重糖尿病未能控制、黄体功能不足，均可导致流产。
（4）创伤：妊娠期特别是妊娠早期时行腹部手术或妊娠中期外伤，导致子宫收缩而引起流产。
4。胎盘内分泌功能不足
妊娠早期时，卵巢的妊娠黄体分泌孕激素外，胎盘滋养细胞亦逐渐产生孕激素。妊娠8周后，胎盘逐渐成为产生孕激素的主要场所。除孕激素外，胎盘还合成其他激素如β-绒毛膜促性腺激素、胎盘生乳素及雌激素等。早孕时，上述激素值下降，妊娠难以继续而致流产。
5。免疫因素
妊娠犹如同种异体移植，胚胎与母体间存在复杂而特殊的免疫学关系，这种关系使胚胎不被排斥。若母儿双方免疫不适应，则可引起母体对胚胎的排斥而致流产。有关免疫因素主要有父方的组织相容性抗原、胎儿特异抗原、血型抗原、母体细胞免疫调节失调、孕期母体封闭抗体不足及母体抗父方淋巴细胞的细胞毒抗体不足等。
引起流产的原因很多，至少有以下10种情况：
1。 孕卵异常 孕卵异常所致的流产，占自然流产半数以上，尤其是在早期流产中。有人分析了1000例流产后发现，孕卵异常占48%。经病理分析后发现，其中63%是卵子发育不良，受精卵早期分裂、蜕变，以致流产。孕卵异常是由于精子或卵子的缺陷，或两者均有缺陷所致。在妊娠早期，与母体缺乏维生素、叶酸、透明质酸酶等物质，妨碍了孕卵的正常发育有关。
2。 前列腺素因素 有人在剖宫终止妊娠的羊水标本中发现并不含前列腺F2或F2a，而在自然流产的羊水标本中，这两种前列腺素的浓度却都很高，前列腺素样活性物质还存在于孕妇的外周静脉血中。由此证明，自然流产时高频率的宫缩是由内源性前列腺素所造成的。
3。 染色体异常 自然流产胎儿经染色体研究发现，60%有核型异常。核型异常者，每每伴有胎儿或胎盘等一种结构上的异常。
4。 内分泌失调 雌激素过多与孕酮不足，是早期流产的原因。因为在妊娠12~14周时正处于胎盘形成代替妊娠黄体功能时期，此时容易内分泌失调。此外，甲状腺素缺乏，使细胞的氧化过程受到障碍，以及甲状腺功能亢进和糖尿病等，均可导致流产发生。
5。 胎盘异常 早期妊娠时，蜕膜炎可使底膜出血或增生，绒毛膜上皮细胞或蜕膜细胞被溶解，绒毛内血管阻塞，影响营养物质的吸收与运送，使孕卵从附着处分离、出血而流产。胎盘的巨大梗塞，可降低胎盘功能，影响胎儿生存，以致流产。此外，前置胎盘、胎盘绒毛水肿变性，也可造成流产。
6。 血型不合 由于以往妊娠或输血RH因子、不合的ABO血型因子在母体内产生抗体，当此次妊娠由胎盘进入胎儿体内与红细胞凝集而产生溶血，以致流产。
7。 生殖器官疾病 子宫畸形，如双角子宫、子宫腔纵膈等，常是流产的原因。患了子宫肌瘤，尤其是粘膜下肌瘤，或得了嵌顿在骨盆腔中的卵巢囊肿，也可影响胎儿发育而导致流产。子宫颈口的松弛，易造成习惯性流产。
8。 绒毛间质胶原样疾病 这种病变，可使绒毛血管退化，从而造成流产。
9。 精神因素 过度紧张、恐惧，严重精神刺激，均可引起流产。
10。 母亲罹患全身性疾病 如急性严重传染病，慢性疾病（如严重贫血、严重高血压、心脏病，慢性肾炎等），维生素缺乏（尤其是维生素E缺乏），以及汞、铅、酒精等慢性中毒，均可造成流产。
