早期诊断类固醇5α-还原酶2缺乏综合征对于明确新生儿的性别取向具有至关重要的作用。SRD5A2的酶活性在不同患者中差异显著，大部分患者的酶活性残留不足0.4%，但也有少数患者能保留3%～15%的酶活性。这使得少数患者的外生殖器男性化相对完整，足以在出生时确定为男性。考虑到青春期可能出现的性别特征变化，新生儿期的准确诊断尤为重要。
曾经报道过一例9个月大的类固醇5α-还原酶2缺乏症儿童，采用每日2%的DHT腹部乳膏治疗，剂量为25mg。仅12天后，其血清DHT水平即达到2.0mol/L（或58g/dl），这一水平已进入成人男性的正常范围内。经过长达四个月的治疗，该患儿的阴茎长度增加了2cm，从原本的1.8cm增长到了3.8cm，且在整个治疗过程中并未出现任何不良反应。在此类情况下，通常会同时进行阴茎尿道成形术或尿道下裂修复术。值得注意的是，DHT治疗目前仍处于实验阶段，尚未正式上市，其长期疗效和安全性尚待进一步验证。
对于此类患者，如果采用超生理剂量的睾酮脂（如庚酸睾酮、十一酸睾酮等）进行肌肉注射（每周250~500mg），可使血清DHT水平达到正常范围，并在一定程度上增强男性化效果。需对外生殖器进行男性整形手术。如果患者在被抚养的过程中被视为女性，那么需要进行女性方向的整形手术，并切除双侧睾丸。到了青春期后，还需要进行雌激素替代治疗。这一系列的医疗干预旨在帮助患者实现与其性别身份相符的身体特征，确保他们能够以真实的自我成长和发展。
