常用紧急避孕药容易引起内分泌紊乱，对卵巢造成不可逆的影响，甚至造成卵巢提前“衰老”，雌激素分泌越来越少甚至突然消失，进入“隐性更年期”，在临床上出现潮热、烦躁失眠、皮肤干燥、发色枯黄、外阴干涩、阴道瘙痒、性欲下降等症状。由于目前对卵巢早衰尚无有效的治疗方法，只能靠周期性使用雌孕激素来替代卵巢功能，患者将失去生育的机会。
